Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx1P80205 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms