Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp3P70677 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp3P70677 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms