Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rit1P70426 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rit1P70426 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rit1P70426 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms