Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms