Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgif1P70284 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms