Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms