Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms