Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms