Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms