Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 297 ms