Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms