Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps11P62281 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps11P62281 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms