Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms