Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms