Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abce1P61222 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms