Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms