Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms