Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms