Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms