Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup43P59235 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms