Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Senp1P59110 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Senp1P59110 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms