Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Paxbp1P58501 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms