Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtdsplP58465 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtdsplP58465 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtdsplP58465 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtdsplP58465 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms