Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms