Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp4P57724 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp4P57724 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp4P57724 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp4P57724 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms