Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gsc2P56916 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gsc2P56916 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gsc2P56916 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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