Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TdgP56581 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TdgP56581 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TdgP56581 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TdgP56581 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TdgP56581 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TdgP56581 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TdgP56581 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TdgP56581 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms