Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a3P56564 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms