Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms