Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms