Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp5P56399 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms