Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdaP56389 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdaP56389 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdaP56389 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdaP56389 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdaP56389 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdaP56389 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CdaP56389 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CdaP56389 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CdaP56389 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms