Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms