Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PltpP55065 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PltpP55065 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PltpP55065 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PltpP55065 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PltpP55065 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PltpP55065 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PltpP55065 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PltpP55065 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PltpP55065 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms