Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GemP55041 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GemP55041 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GemP55041 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GemP55041 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GemP55041 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GemP55041 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GemP55041 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GemP55041 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GemP55041 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GemP55041 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms