Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn5P54830 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn5P54830 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms