Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms