Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf9P54130 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms