Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms