Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms