Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms