Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApodP51910 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApodP51910 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApodP51910 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ApodP51910 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApodP51910 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms