Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms