Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntfP51642 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfP51642 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfP51642 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfP51642 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfP51642 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfP51642 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntfP51642 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntfP51642 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntfP51642 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntfP51642 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntfP51642 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfP51642 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfP51642 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfP51642 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfP51642 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntfP51642 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms