Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa6P50704 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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