Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TspoP50637 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TspoP50637 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TspoP50637 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TspoP50637 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TspoP50637 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TspoP50637 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TspoP50637 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TspoP50637 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TspoP50637 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TspoP50637 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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