Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TubP50586 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TubP50586 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TubP50586 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TubP50586 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TubP50586 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TubP50586 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms