Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpdP50404 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms