Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms