Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms